MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015688	AAT	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015688	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015688	ATAA	2	8	92	99	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015688	TA	3	6	106	111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015688	TAT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015688	GA	3	6	164	169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015688	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015688	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015688	AATT	2	8	312	319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015688	T	6	6	345	350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015688	TA	4	8	375	382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015688	TACA	2	8	401	408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015688	T	6	6	452	457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015688	ATAA	2	8	506	513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015688	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015688	CTC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015688	CATA	2	8	556	563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015688	A	7	7	573	579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015688	ATT	2	6	583	588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015688	A	7	7	602	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015688	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015688	A	7	7	669	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015688	ATT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015688	TAG	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015688	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015688	TTGG	2	8	791	798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015688	TAAT	2	8	814	821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015688	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015688	A	6	6	879	884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015688	ATA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015688	TAT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015688	ACTA	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015688	ACA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015688	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015688	TTAAT	2	10	2416	2425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015688	TAT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015688	AGG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015688	TAT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015688	ATG	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015688	AATT	2	8	2573	2580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015688	ATAA	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015688	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015688	A	6	6	2698	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015688	TTAA	2	8	2744	2751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015688	ATA	3	9	2769	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015688	ACC	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015688	AAT	2	6	3367	3372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015688	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015688	ATG	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015688	AT	4	8	3407	3414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015688	TAT	3	9	3428	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015688	AT	3	6	3445	3450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015688	GA	3	6	3464	3469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015688	TGT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015688	TAA	3	9	3502	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015688	GTA	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015688	AT	3	6	3607	3612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015688	AAT	2	6	3655	3660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015688	TA	3	6	3662	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015688	TAA	3	9	3673	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015688	T	7	7	3699	3705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015688	TAT	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015688	TAATAT	2	12	3717	3728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015688	TTC	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015688	TAT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015688	TAG	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015688	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015688	T	8	8	3818	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015688	TA	3	6	3892	3897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015688	ATG	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015688	T	7	7	5007	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015688	ATA	2	6	6063	6068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015688	TAA	2	6	6084	6089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015688	GTA	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015688	TAAA	2	8	6151	6158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015688	TCT	2	6	6201	6206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015688	TATT	2	8	6269	6276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015688	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015688	TGT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015688	AAT	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015688	GTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015688	TA	3	6	6422	6427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015688	AT	3	6	6531	6536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015688	AAAAT	2	10	6697	6706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015688	AGA	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015688	ATTAA	2	10	6806	6815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015688	TGC	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015688	A	6	6	7045	7050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015688	TAA	2	6	7058	7063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015688	AT	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015688	T	6	6	7105	7110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015688	ACA	3	9	7156	7164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015688	TTAAA	2	10	7185	7194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015688	TTG	3	9	7222	7230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015688	TAA	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015688	A	6	6	7246	7251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015688	AT	3	6	7870	7875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015688	AT	3	6	7887	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015688	AAT	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015688	CTTG	2	8	7928	7935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015688	AAAATT	2	12	7937	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015688	C	6	6	8012	8017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_015688	AT	3	6	8040	8045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015688	TAATA	2	10	8046	8055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015688	A	8	8	8055	8062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015688	TCC	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015688	ACTA	2	8	9100	9107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015688	T	6	6	9115	9120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015688	T	6	6	9137	9142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015688	AT	3	6	9144	9149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015688	T	6	6	9153	9158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015688	TA	3	6	9187	9192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015688	AAT	2	6	9238	9243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015688	TAGT	2	8	9247	9254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015688	GT	3	6	9258	9263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015688	TAT	2	6	9293	9298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015688	T	7	7	9333	9339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015688	TAG	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015688	AATA	2	8	9405	9412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015688	A	7	7	9415	9421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015688	TA	3	6	9431	9436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015688	TAA	2	6	9447	9452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015688	TA	3	6	9465	9470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015688	T	6	6	9505	9510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015688	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015688	TAAATT	2	12	9555	9566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015688	ATT	2	6	9569	9574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015688	TA	3	6	9588	9593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015688	ATT	2	6	9636	9641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015688	TAA	3	9	9652	9660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015688	ATA	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015688	AT	3	6	9683	9688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015688	TA	4	8	9697	9704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015688	TAATA	2	10	9706	9715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015688	A	7	7	9715	9721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015688	AAC	2	6	10459	10464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015688	TTA	2	6	10529	10534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015688	TA	4	8	10556	10563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015688	A	7	7	10587	10593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015688	TAAA	2	8	10625	10632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015688	TTA	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015688	AT	3	6	10728	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015688	TAC	2	6	10757	10762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015688	ATT	2	6	10773	10778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015688	ATTAA	2	10	10826	10835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015688	TGGC	2	8	10912	10919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015688	TAA	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015688	ATTT	2	8	10959	10966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015688	GAA	2	6	10985	10990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015688	AAGAT	2	10	11053	11062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015688	T	6	6	11072	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015688	ATACT	2	10	11086	11095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015688	AAT	2	6	11109	11114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.